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                膜蛋白研究推薦工具——去垢劑

                更新時間:2023-09-12      點擊次數:1509

                膜蛋白是結合或整合在細胞膜或細胞器上的一類蛋白,在各種重要的生理活動中發揮著重要作用。人類基因組約三分之一的基因都用于編碼膜蛋白[1-2]。作為生物膜功能的主要承擔者,膜蛋白負責細胞內外和細胞間的物質運輸、能量傳遞和信息傳導等。其功能紊亂常常與人類重大疾病相關,因此膜蛋白是一類非常重要的藥物靶點。


                圖1 細胞膜結構示意圖

                 

                去垢劑也稱為表面活性劑是一類同時具有親水頭部和疏水尾部的分子,能夠使脂膜解體釋放膜蛋白并維持去膜狀態下膜蛋白結構和功能的穩定性。去垢劑的雙極性和理化特性如臨界膠束濃度能夠極大影響去垢劑和膜蛋白間的相互作用。在膜蛋白研究中需要充分利用去垢劑的結構和特性:一方面需要利用去垢劑代替脂質分子支持和穩定去膜狀態下膜蛋白的結構和功能;另一方面需要控制去垢劑和膜蛋白的相互作用以滿足膜蛋白結構研究如蛋白質結晶試驗的要求。


                圖2 去垢劑結構、膠束的形成和在膜蛋白中的應用

                 

                按照所帶電荷情況,去垢劑可大致分為離子型去垢劑、非離子型去垢劑和兩性離子去垢劑。

                 

                離子型去垢劑可分為陽離子型去垢劑和陰離子去垢劑,其分子整體帶有凈電荷,能夠與膜蛋白發生較強的相互作用,因此能夠高效的將膜蛋白從生物膜上提取出來。膜蛋白研中應用較早的去垢劑大多為提取率較高的離子型去垢劑但這種相互作用極易破壞膜蛋白的結構和功能,得到的膜蛋白去垢劑復合物無法滿足大多數下游研究的要求。

                 

                表1  常用離子型去垢劑

                貨號

                產品名稱

                CAS號

                 規格

                abs47047835

                十二烷基硫酸鈉(SDS)

                151-21-3

                500g

                abs47047781

                十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)

                57-09-0

                500g

                abs42075879

                十二烷基三甲基溴化銨

                1119-94-4

                100g

                abs42147674

                脫氧膽酸鈉

                302-95-4

                100g

                abs44058186

                膽酸鈉

                361-09-1

                100g

                 







                非離子型去垢劑,也稱中性去垢劑,其分子內不帶電荷,但其形成的膠束與生物膜磷脂雙分子層體系類似,因此可以將膜蛋白從生物膜上有效的溶解下來。中性去垢劑主要靠疏水相互作用來溶解膜蛋白,溶解下膜蛋白后,在膜蛋白疏水部位附著,形成膜蛋白去垢劑復合物。由于疏水相互作用力較弱,所以中性去垢劑對膜蛋白的溶解效率較低,但是能夠很大程度上保護膜蛋白結構和功能的完整性。

                 

                n-辛基-β-D-吡喃葡萄糖苷用于溶解處于天然狀態的膜結合蛋白和制備脂質囊泡。其明確的化學結構、小而均勻的膠束和高水溶性使其在膜溶解方面優于大多數其他非離子型去垢劑。由于n-辛基-β-D-吡喃葡萄糖苷臨界膠束濃度在20-25mM,與膽汁酸及其鹽類相比,其具有易通過透析去除的額外優勢。

                 

                表2  常用非離子型去垢劑

                貨號

                產品名稱

                CAS號

                 規格

                abs42155185

                n-辛基-β-D-吡喃葡萄糖苷(OGP)

                29836-26-8

                5g

                abs44070481

                十二烷基-β-D-麥芽糖苷(DDM)

                69227-93-6

                1g

                abs9149

                Triton X-100

                9002-93-1

                500mL

                abs47047434

                Triton X-114

                9036-19-5

                1L

                abs9152

                吐溫-20

                9005-64-5

                500mL

                 







                兩性去垢劑分子整體不帶凈電荷,但其分子內一般帶由等量相反的電荷,其對蛋白的溶解性和結構功能的破壞性大多處于離子型去垢劑和中性去垢劑之間

                 

                CHAPS可用于溶解膜蛋白以及打斷蛋白與蛋白之間的相互作用,具有低膠束分子量和高臨界膠束濃度的特點,因此可通過透析從樣品中除去。它也適合在等電聚焦和二維電泳中溶解蛋白質。CHAPS常用于非變性(無尿素)等電聚焦,已發現它對某些亞細胞制備物和植物蛋白能夠得出優異的分辨率。通常將介于2-4%(w/v)間的濃度用于等電聚焦凝膠。而CHAPSO具有更多的極性頭部基團,因此相比于CHAPS其更易溶解膜蛋白。

                 

                表3  常用兩性去垢劑

                貨號

                產品名稱

                CAS號

                 規格

                abs42015226

                3-[3-(膽酰胺丙基)二甲氨基]-1-丙磺酸內鹽(CHAPS)

                75621-03-3

                25g

                abs42073626

                3-[(3-膽固醇氨丙基)二甲基氨基]-2-羥基-1-丙磺酸(CHAPSO)

                82473-24-3

                500mg

                 


                參考文獻


                [1] MARTIN J,SAWYER A. Elucidating the structure of membrane proteins[J]. BioTechniques,2019,66(4): 167-70.
                [2] STEVENS TJ, ARKIN I T. The effect of nucleotide bias upon the composition and predictionof transmembrane helices[J]. Protein Sci, 2000, 3.

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